Xromosomal mikroarray analizi (XMA) DNT nüsxələrinin sayının artması (duplikasiya) və ya genetik elementin bir hissəsinin itirilməsi ilə bağlı müəyyən mutasiyaların olması üçün karyotipi qiymətləndirmək üçün yüksək texnologiyalı üsuldur. material (silmək). Belə anomaliyalar tez-tez irsi xəstəliklərə səbəb olur, buna görə də CMA müasir tibbdə mühüm diaqnostik vasitədir. Tipik olaraq, bu texnologiya dölün, həmçinin yeni doğulmuş körpələrin və uşaqların genotipini yoxlamaq üçün istifadə olunur.
Metodun ümumi xüsusiyyətləri
Mikroarray xromosom analizi başqa cür molekulyar karyotipləşdirmə adlanır. Metod, daşıyıcıya (matris) daxil edilmiş genetik markerlərlə (əvvəllər məlum olan xüsusi nukleotid ardıcıllıqları) DNT hibridləşməsi texnologiyasına əsaslanır. Tədqiqat təhlil etməyə imkan verirxromosomların çoxlu bölmələri və genetik materialın çatışmazlığı və ya artıqlığı ilə bağlı struktur dəyişikliklərinin (abberasiyaların) mövcudluğunu müəyyənləşdirin.
Metod genlərdə nöqtə mutasiyalarını aşkar etmək üçün nəzərdə tutulmayıb, lakin ənənəvi karyotipləşdirmədən daha yüksək ayırdetmə qabiliyyətinə malikdir. CMA müxtəlif xəstəliklərin, o cümlədən anadangəlmə anomaliyaların və əqli geriliyin patogenezində mühüm rol oynayan submikroskopik dəyişiklikləri aşkar edə bilər.
Molekulyar karyotipləşdirmənin mənası
CMA-nın əsas məqsədi standart nümunəyə nisbətən genetik məlumatın kiçik əlavə (mikroduplikasiya) və ya çatışmayan (mikrodelesiya) fraqmentlərini müəyyən etməkdir. Bu sapmalara nüsxə sayı variasiyaları (CNV) deyilir.
"Mikro" prefiksi o deməkdir ki, bu texnologiya çox kiçik dəyişiklikləri aşkarlamağa yönəlib. Bununla belə, CMA müxtəlif anöploidiyalar (Daun sindromu, Patau və s.) kimi əsas xromosom anomaliyalarını aşkar etmək üçün də uyğundur. Bununla belə, tədqiqat tək bir gen daxilində dəyişiklikləri müəyyən edə bilmir.
Mikrodelesiyalar və mikroduplikasiyalara əlavə olaraq, analiz xromosomların böyük hissələrinin genetik kimliyini aşkar edir, bu da göstərə bilər:
- uşağın valideynlərinin qan qohumluğu;
- yalnız bir valideyndən xromosomların hər iki nüsxəsini əldə etmək.
XMA ilə siz də aşkarlaya bilərsiniztranslokasiyalar, lakin onlar balanslaşdırılmış olmadıqda.
Xromosomal mikroarray analizi genotipin şifrəsini açmaq üçün bir yol və ya hər hansı geni aşkar etmək üsulu deyil. Bu tədqiqat yalnız xəstənin xromosomlarındakı genetik materialın miqdarını nəzarətlə müqayisə etmək məqsədi daşıyır. CNV aşkar edildikdən sonra laboratoriya orada hansı genlərin olduğunu müəyyənləşdirir və bunun əsasında nəticəni şərh edir. Kopiya nömrəsi variantları müxtəlif xəstəliklərin patogenezində mühüm rol oynayır, lakin onların mövcudluğu heç də həmişə anormallıqlara səbəb olmur.
Araşdırma məqsədi
Xromosomal mikroarray analizi körpədə səbəb ola biləcək CNV-lərin olub olmadığını yoxlamaq üçün aparılır:
- autizm;
- qlobal geriləmə;
- zehni gerilik;
- müxtəlif doğuş qüsurları;
- konvulsiyalar;
- qeyri-adi fiziki xüsusiyyətlər (dismorfizmlər);
- anadangəlmə anomaliyalar.
Tədqiqat həmçinin ədədi xromosom anomaliyalarının (Daun Sindromu və s.) olub-olmamasını müəyyən edir.
XMA testini keçirməyin 2 əsas səbəbi var:
- profilaktik - uşağın genomunun mikrodelesiya və ya mikroduplikasiya üçün yoxlanılması;
- diaqnostik - CNV ilə əlaqəli ola biləcək müxtəlif xəstəliklərin genetik səbəblərini müəyyən etmək üçün həyata keçirilir.
Bəzən tədqiqatın nəticələrini dəqiqləşdirmək üçün valideynlərin genomunun yoxlanılması aparılır.
Beynəlxalq standarta və bir sıra tibbi icmaların tövsiyələrinə əsasən,CMA anadangəlmə anomaliyaları, autizmi və ya mənşəyi naməlum inkişaf qüsurları olan şəxslər üçün hazırlanmış səviyyə 1 testidir.
Xromosomal mikroarray analizinin çoxsaylı rəyləri onun mühüm diaqnostik əhəmiyyətini təsdiqləyir. Metod, ümumi və kifayət qədər aşkar xromosom pozğunluqları (məsələn, Daun sindromu) olmadıqda bir uşaqda problemlərin genetik səbəblərini tapmağa imkan verir. Bəzən CMA, əksinə, inkişaf problemləri olan uşaqlarda xromosom pozğunluqlarının mövcudluğunu istisna etməyə kömək edir. Bu cür nəticələr əlverişli hesab olunur, çünki əldə edilmiş qüsurlar düzəldilə bilər, genetik pozğunluqlar isə düzəldilə bilməz.
Metod texnologiyası
XMA eyni vaxtda çoxlu sayda müxtəlif DNT fraqmentlərini təhlil etməyə imkan verir, onların hər biri matrisdə çap olunmuş xüsusi genetik markerə uyğundur. Sonuncu minlərlə belə zondla əhatə olunmuş mövzu yığınıdır.
2 növ DNT test üçün istifadə olunur:
- xəstə;
- standart (normal insan genomuna uyğundur).
Matrisə genetik material tətbiq edilir, burada zondlar və onların müvafiq nümunə fraqmentləri arasında hibridləşmə reaksiyası baş verir. Yəni, xromosomların eyni bölmələrindən olan ardıcıllıqlar bir-biri ilə birləşdirilir.
Xüsusi cihaz hər bir zondun idarəetmə və prototiplə hibridləşmə dərəcəsini ayrıca qiymətləndirir. Normaldahalda, eyni olmalıdır. Xəstənin hər hansı fraqmentində artıq genetik material varsa, cihaz yaşıl siqnal verir, çatışmazlıq varsa, qırmızıdır.
Beləliklə, matrisin markerləri ehtiva etdiyi genomun bütün bölgələri qiymətləndirilir. Alət siqnalları skaner tərəfindən tutulur və kompüter tərəfindən emal edilir.
XMA növləri
3 növ xromosom mikroarray analizi var:
- hədəf;
- standart;
- uzadıldı.
Onların əsas fərqi istifadə olunan DNT markerlərinin sayı ilə tənzimlənən rezolyusiyadadır. Bu parametr başqa cür matrisin sıxlığı adlanır. Hədəf təhlilində ən aşağıdır (350 min marker). Bu, ən çox yayılmış mikrodelesiyaları və mikroduplikasiyaları aşkar edən ən əlçatan və ən ucuz test növüdür. CNV ilə əlaqəli məlum spesifik sindromları təsdiqləmək üçün istifadə olunur.
Standart HMA insan genomunun bütün klinik əhəmiyyətli bölgələrini sınaqdan keçirən 750.000 markerdən istifadə edir. Bu test yalnız ümumi CNV-ləri deyil, həm də fərqlənməmiş sindromlara səbəb olan xromosom anomaliyalarını aşkar edir. Eyni funksiya, lakin daha çox məlumatlandırıcı, genişləndirilmiş xromosom mikroarray analizi ilə həyata keçirilir. O, 2,67 milyon DNT markerindən ibarət matrislə genomun ən dərin tədqiqini təmsil edir.
XMA Effektivliyi
XMA xromosom anomaliyalarını aşkar etmək üçün müasir və çox effektiv üsuldur. əvvəl onlar üçünaşkarlama xəstənin xromosomlarının vizual təftişindən ibarət standart sitogenetik metoddan istifadə edilmişdir. Müqayisə üçün, molekulyar karyotipləşdirmənin həlli 1000 dəfə yüksəkdir və əvvəllər aşkar edilə bilməyən ən kiçik dəyişiklikləri tapmağa imkan verir. Bu, diaqnostik məhsuldarlığı 10 artırdı. Bundan əlavə, CMA hüceyrələrin əvvəlcədən kulturasını tələb etmir və eyni zamanda xromosomların bir çox bölgəsini təhlil etməyə imkan verir.
Müəyyən bir xəstə üçün molekulyar karyotipləşdirmənin faydalılığı aşağıdakılardan asılıdır:
- seçilmiş analiz növünün (qabaqcıl, hədəflənmiş və ya standart);
- nəticənin düzgün qiymətləndirilməsi;
- avadanlıq və xüsusi laboratoriyanın istifadə etdiyi DNT çipləri dəsti (matrisdə quraşdırılmış markerlər).
Xromosom mikroarray analizini həyata keçirə biləcəyiniz ən keyfiyyətli tibbi genetik mərkəzlərdən birinin adı "Genomed"dir. Bu müəssisə haqqında rəylər onu müasir texnoloji avadanlıqlara malik yüksək səviyyəli tibb təşkilatı kimi təsvir edir və bu, olduqca nadir olanlar da daxil olmaqla, müxtəlif genetik testlərin geniş spektrini həyata keçirməyə imkan verir. XMA üçün "Genomed"də (Moskva, Podolskoe şossesi, 8) aparıcı istehsal şirkətinin DNT markerləri dəstlərindən istifadə olunur.
